Glavno raziskovalno področje Draga Perka je razvrščanje pokrajinskih enot z geografskimi informacijskimi sistemi. Izdelal je več pokrajinskih tipizacij Slovenije. Najbolj uveljavljena je iz leta 1995 (zadnjič dopolnjena 2021) z 12 tipi. Pomembni področji sta še geomorfometrija in zemljepisno imenoslovje.

Vodil je številne projekte. Med najpomembnejšimi so aplikativni projekti Določanje naravnih pokrajinskih tipov Slovenije z geografskim informacijskim sistemom (med letoma 2010 in 2013), Pokrajinska raznolikost in vroče točke Slovenije (med 2014 in 2017) ter Geografske osnove za arbitražni postopek za določitev slovensko-hrvaške meje (med 2011 do 2012).
(So)ustanovil je knjižne zbirke Geografija Slovenije (leta 1999), Georitem (2007), GIS v Sloveniji (1992) in Regionalni razvoj (2007). Med letoma 1999 in 2007 je bil urednik revije Geografski vestnik, od leta 2011 pa je odgovorni urednik revije Acta geographica Slovenica. Je član več uredniških odborov slovenskih in evropskih publikacij.

Je soavtor in sourednik obsežnih temeljnih geografskih in kartografskih del o Sloveniji: Krajevni leksikon Slovenije (leta 1995), Geografski atlas Slovenije (1998), Slovenija: pokrajine in ljudje (1998), Nacionalni atlas Slovenije (2001), faksimile Atlanta, prvega atlasa sveta v slovenščini (2006), Popisni atlas Slovenije 2002 (2007), Slovenia in Focus (2007), Terasirane pokrajine (2016) in The Geography of Slovenia: Small but Diverse (2020). 
 

Izobrazba
diploma iz geografije in sociologije, Filozofska fakulteta Univerze v Ljubljani, 1985
magisterij iz geografije, Filozofska fakulteta Univerze v Ljubljani, 1989
doktorat iz geografije, Filozofska fakulteta Univerze v Ljubljani, 1993

• Perko, D. 2023: The first world atlas in Slovenian, and Slovenian territory in some early world atlases. Acta geographica Slovenica 63-2.
• Perko, D., Ciglič, R., Hrvatin, M. 2021: Landscape macrotypologies and microtypologies of Slovenia. Acta geographica Slovenica 61-3.
• Perko, D., Ciglič, R. 2020: Slovenia's landscapes. The geography of Slovenia: small but diverse. Springer, Cham.
• Ciglič, R., Štrumbelj, E., Češnovar, R., Hrvatin, M., Perko, D. 2019: Evaluating existing manually constructed natural landscape classification with a machine learning-based approach. Journal of Spatial Information Science 18.
• Perko, D., Ciglič, R., Hrvatin, M. 2019: The usefulness of unsupervised classification methods for landscape typification: the case of Slovenia. Acta geographica Slovenica 59-2.
• Perko, D., Zorn, M., Ciglič, R., Breg Valjavec, M. 2019: Changing river courses and border determination challenges: the case of the Slovenian-Croatian Border. Geospatial challenges in the 21st century. Springer, Cham.
• Ciglič, R., Perko, D. 2017: A method for evaluating raster data layers according to landscape classification scale. Ecological informatics 39.
• Perko, D., Hrvatin, M., Ciglič, R. 2017: Določanje pokrajinskih vročih točk Slovenije. Acta geographica Slovenica 57-1.
• Perko, D., Hrvatin, M., Ciglič, R. 2015: Metodologija naravne pokrajinske tipizacije Slovenije. Acta geographica Slovenica 55-2.
• Perko, D., Ciglič, R. 2015: Slovenia as a European landscape hotspot. Acta Geobalcanica 1-2.
• Ciglič, R., Perko, D. 2015: Modelling as a Method for Evaluating Natural Landscape Typology: The Case of Slovenia. Landscape Analysis and Planning. Springer, Heidelberg.
• Ciglič, R., Perko, D. 2013: Pokrajinske vroče točke Evrope. Acta geographica Slovenica 53-1.

• Določanje naravnih pokrajinskih tipov Slovenije z geografskim informacijskim sistemom (temeljni raziskovalni projekt • 01. maj 2010 - 30. april 2013)
• Terasirane pokrajine (aplikativni raziskovalni projekt • 01. julij 2011 - 31. december 2015)
• Kulturna pokrajina v precepu med javnim dobrim, zasebnimi interesi in politikami (temeljni raziskovalni projekt • 01. oktober 2014 - 30. september 2017)
• Pokrajinska raznolikost in vroče točke Slovenije (aplikativni projekt • 01. oktober 2014 - 28. februar 2018)
• Napredek računsko intenzivnih metod za učinkovito sodobno splošnonamensko statistično analizo in sklepanje (aplikativni projekt • 01. marec 2016 - 28. februar 2019)
• Geografija Slovenije - nacionalni raziskovalni program (raziskovalni program • 01. januar 2022 - 31. december 2027)
• Standardizacija hidronimov v Registru zemljepisnih imen (ciljni raziskovalni projekt • 01. september 2021 - 31. avgust 2024)
• Življenje in smrt kulturnih teras: zaznavanje in prostorska analiza teras z računalniškimi metodami (aplikativni raziskovalni projekt • 01. januar 2025 - 31. december 2027)

• Zaslužni raziskovalec ZRC SAZU, 2025
• Zlata plaketa Zveze geografov Slovenije, 2022
• Srebrna plaketa Zveze geografov Slovenije, 2009
• Zlati znak ZRC, 1999
• Kidričeva nagrada za dodiplomski študij, 1986
• Bronasta plaketa Zveze geografskih društev Slovenije, 1997
• Vajglova nagrada za magistrsko nalogo, 1989
• Študentska Prešernova nagrada Filozofske fakultete za diplomsko nalogo, 1986

• član Komisije za standardizacijo zemljepisnih imen Vlade Republike Slovenije (od 1995)
• predsednik Upravnega odbora ZRC SAZU (od 2019)
• odgovorni urednik znanstvene revije Acta geographica Slovenica/Geografski zbornik (od 2011)
• sourednik knjižne zbirke Geografija Slovenije (od 1999)
• sourednik knjižne zbirke Georitem (od 2007)
• sourednik knjižne zbirke GIS v Sloveniji (od 1992)
• sourednik knjižne zbirke CAPACities (od 2010)
• član uredniškega odbora knjižne zbirke Thought, society, culture, Peter Lang Verlag, Frankfurt am Main (od 2013)
• član uredniškega odbora znanstvene revije Acta geographica Slovenica/Geografski zbornik (od 1995)
• član uredniškega odbora znanstvene revije Geografski vestnik (od 1999)
• član uredniškega odbora znanstvene revije Acta Geobalcanica (od 2015)
• član uredniškega odbora revije National Geographic Slovenija (od 2006)
• član organizacijskih odborov bienalnih simpozijev Geografski informacijski sistemi v Sloveniji in Regionalni razvoj v Sloveniji