V muzeju je združenih sedem zbirk. Zbirka zemljevidov obsega zemljevide različnih vsebin in meril vse od 16. stoletja do sodobnosti. Večina gradiva se nanaša na slovensko ozemlje in sosednje dežele. Zbirka slik obsega razglednice in fotografije slovenskih krajev in pokrajin ter manjše število bakrotiskov. Zelo pomembna je zbirka atlasov, ki obsega številne izjemno redke primerke atlasov najbolj znanih svetovnih avtorjev in odseva razvoj upodobitev sveta skozi čas. Zbirka globusov obsega globuse različnih dimenzij in starosti ter redke globusne prikaze ozvezdij. Zbirka knjižnih del obsega publikacije, povezane z geografsko, kartografsko in zgodovinsko tematiko. Zbirka kartografskih in geografskih pripomočkov hrani orodja, ki so jih kartografi in geografi uporabljali za izdelovanje »klasičnih« zemljevidov pred uveljavitvijo digitalne kartografije ter zanimive geografske terenske pripomočke. Zbirka statističnih podatkov obsega statistično gradivo o Sloveniji in tematskih zemljevidih njenega ozemlja.
Povezava do Zemljepisnega muzeja.